机械帝国和人类之间的战争一经开始，好像就很难有一个可以停止的界限，一方面机械帝国急于消灭人类使得人造人成为宇宙中的唯一主宰；另一方面，自然人类也不愿意被人造人所淘汰因而灭绝，并且从此退出宇宙生物历史，成为永恒的化石。所以这场战争自开始起，就充满了一种注定惊心动魄的意味，毕竟这不是传统中人类之间为了争夺生存空间而采取的掠夺性战争，而是真正残酷的一个新生适应性物种淘汰另外一个旧物种的生存竞争性战争。

卡洛宣布了与方芳之间的婚约，这在引发了一场行双星执政层中Z星人与地球人是否应该婚姻争论的同时，还激起了机械帝国王勇对自然人类缔结合约后对自己威胁加大的担忧。机械帝国决定设法破坏这次婚姻，不管付出怎样的代价和精力。卡洛可能与方芳还引起了另外一个人的担忧，那就是刘媛，因为方芳的火星超级战士身份意味着火星的军事秘密将被Z星人所完全掌握。那么一旦战争结束，Z星人在军事实力上很容易就可以征服火星，使得双星联盟成为Z星人专政，从而造成火星的衰落。在一片反对声中，卡洛只好推迟了与方芳的婚礼，两个人继续做密友。

为了保护人类边远行星不受机械帝国的侵扰，卡洛建立了一支装备精良的双星快速反应部队，集中了大量超能战士，在加强边防的同时，随时增援受到袭击的行星。尽管这样，属于Z星系的几颗边境行星还是遭到了机械帝国的偷袭，大量的居民被就地改造成僵尸般的电子复合人。由于遭到机械帝国数次袭击后，宇宙中自然人类数量迅速减少，而火星和Z星等高等文明行星由于人类寿命的延长，人口自然生育率很低，再加上自然人类成长时间较为漫长，但机械帝国几乎毫不间断的大批量生产各种人造人，双星的军事实力无论从军队数量还是军备数量上目前都落后于机械帝国。无奈之下，卡洛决定双星联盟采取休养生息的策略，暂时不向机械帝国发起新的反攻，而致力于研制机器人电脑病毒和别的针对性武器。试图在别的方面找到战争的突破点。

方芳在了解到Z星人传统的变化之后，决定帮助卡洛建立起宇宙中最为强大的人类联盟。虽然她以前也曾经有同样的梦想，试图致力于进一步富强火星，但是刘媛的不信任造成了她的理想最终无法实现。如今在双星联盟的基础上，她重新开始了自己的梦想，决定帮助卡洛建立起一支宇宙中最为强大的超级战士军队。

王勇和琼此时也正在矛盾重重，毕竟他俩都是克隆人，由于具有极其类似的优化基因身体，所以很容易造成遗传缺陷，这是现代生物工程经过多年验证后得出的结论，再加上当时火星人口的高度膨胀，为此火星遗传基因公司采取了取消生育能力的种种措施，导致火星输出的优良基因克隆人都不具备生育能力。但是现在王勇忽然感觉到自己应该有一个属于自己的后代，也许这是作为克隆人具有人类自然属性的一种表现吧，但是这一想法遭到了琼的极力反对，因为这样做的必然结果就是导致机械帝国丧失优良基因，逐渐沦落为普通的人类，并且使得现在正在进行的与自然人类争夺宇宙霸权的战争因此变得毫无意义。

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