积蓄了力量的新唐军队再次发力，5天内，新唐军队投入菲律宾战场的3个伞兵师先后空降于科兰布甘，萨尔瓦多，苏勒坦三地，形成一条松散的防线，阻止日军援兵从棉兰老岛西部进入。此时位于这一线的日军只有2万，在激烈的争夺之后，新唐伞兵部队站稳了脚跟，然而，在源源而至的日军面前，伞兵部队渐渐陷入困境，有些已经被日军分割包围。3月18日，3个海军陆战师在苏勒坦登陆，5万多大军在两天的激战后将日军赶回了棉兰老岛西部，解救了损失惨重的伞兵部队。

位于棉兰老岛南部哥打巴托的日军司令部与西部的主力被切断了，所有人都明白棉兰老岛的陷落就在眼前了，外有新唐军队的沉重打击，内有菲律宾人不惜任何代价的疯狂破坏，司令部的每个人都沉浸在失败的沮丧气氛中。

日本帝国的大脑与心脏——东京，仅仅5个月就败相尽显的菲律宾防御作战让日军大本营参谋部愁眉不展。日军已经在菲律宾投入了约60万兵力，却仍旧是一败涂地，澳大利亚的南方军司令部已经借口新唐海军的封锁拒绝再派遣增援部队去填这个无底洞了。

日军主力舰队的重建刚刚完成，可现在这支舰队要想达到基本完善的程度，起码还需要半年到一年的时间。挽救南方战局，舰队就必须与新唐海军进行决战，但万一再次决战失利，日本帝国的日薄西山就无法逆转了。最终，御前会议决定，集中所有资源尽最大努力加紧建造几艘主要战舰，争取半年后与新唐舰队进行决战，击败新唐海军掌握战争主动权。。。

3月27日，日军第五方面军司令部被新唐陆军67师213旅摧毁，6天后棉兰老岛南部的日军被全部肃清，13天后中部日军也被全部消灭。4月12日，新唐舰队，海军航空兵，陆军航空兵，伞兵，海军陆战队，陆军步兵师发起协同攻击，棉兰老岛西部的**万日军陷入了一片混乱，5月9日，最后一名日军放下了手中的步枪，棉兰老岛陷落了。

随后的一周内，棉兰老岛西南方的苏禄群岛和南方的萨兰加尼群岛以及其周边的几座岛屿亦落入了新唐军队的手中，由于日军第五方面军并没有将注意力放在这些地方，防御极为薄弱，因此新唐军队的进展极快。5月20日，占领了苏禄海所有岛礁的新唐军队开始攻击菲律宾群岛西南部的巴拉望群岛，困兽犹斗的日本守军只坚持了两个星期。菲律宾只剩下盘踞于中部米沙鄢群岛的约13万日军了。

正当菲律宾人欣喜若狂的翘首以待之时，新唐军队却因为长期作战的疲乏而暂时进入了休整状态。

唐历391年6月11日，经过艰苦的谈判，由菲律宾各部落和各组织推举出来的代表，菲律宾民族独立运动组织领导人埃罗斯特与新唐帝国外交大臣齐靖玉在马尼拉签定了《马尼拉协定》。协定约定：

一，新唐帝国将帮助菲律宾培养大批行政管理人员；

二，两年的过渡期满后，菲律宾可以独立建国；

三，菲律宾现在起就可以组建临时政府，在新唐帝国专业人员的指导帮助下开始工作；

四，新唐帝国帮助菲律宾组建警察部队，其中限额2万的武装警察部队装备日制手枪和手动步枪（机枪和火炮不装备）；

五，新唐帝国有责任帮助菲律宾维持国内秩序和承担菲律宾的安全防卫义务；

六，菲律宾的各种资源对新唐帝国以优惠价格敞开供应；

七，新唐帝国可以在菲律宾长期驻扎一定数量的军队和拥有一定数量的军事基地。

此协定一出，世界哗然，菲律宾已经沦为了新唐帝国的属国（美国华盛顿邮报评论），而一直梦想着能够重返30年前被日本帝国夺取的这些殖民地的英吉利王国更是不择手段的强硬反对，不仅号召全世界对新唐帝国的无耻行为进行制裁，甚至将与新唐帝国的外交关系从大使级降低到了代办级。只是国际上对英国的幼稚行为应者寥寥，被激怒的新唐帝国上下却掀起了一股反对英国的浪潮（这是短视的英国人犯下的最愚蠢的错误——德意志帝国皇帝威廉一世），位于欧洲大陆的德意志帝国趁此天赐良机大力加深了与新唐帝国的交流。。。

6月15日，新唐军队进攻米沙鄢群岛，两个月后，8月23日，十个月零十天的菲律宾战役落下了帷幕。在这场规模空前的岛屿争夺战中（作战双方投入部队超过100万），日军损失61万，105艘舰艇，接近1800架战机，540辆战车和5300门火炮丧失，强大的日本帝国南方军在菲律宾彻底惨败，全军尽没。

冲绳战役和菲律宾战役吞没的日军多达104万，即使日军使尽浑身解数也始终无法获得主动，由于大批部队成建制的损失，日军不得不投入更多的新部队，没有作战经验的官兵在战场上遭遇了极大伤亡，日军就只能依靠不断增加部队的数量来应对。这一恶性循环被久经沙场考验的新唐军队充分利用，从而获得了骄人的战果。

在《马尼拉协定》签署之后，新唐帝国的大批矿业工作者涌入了菲律宾。与曾经的英国人和日本人不同，在新唐帝国承包建设的矿山和冶矿厂中工作的菲律宾人有着不错的收入（对于菲律宾人而言），可靠的安全保障，良好的生活条件，更加令人难以置信的是，冶矿厂每出产一吨金属都要付给菲律宾政府一定的税金。而且，为了给菲律宾人提供更多的工作岗位，新唐帝国在菲律宾开采的每一吨矿石都在当地的冶矿厂冶炼（这样也可以大大降低将资源运回新唐帝国的成本，同时也可以避免矿石冶炼产生的污染问题）。菲律宾从政府到普通民众都从中得到了相当的收益，所有人都觉得，日本帝国和英吉利王国的掠夺压榨屠杀与新唐帝国的仁政德政相比，简直就是地狱与天堂，恶魔与天使的巨大差异。因此，绝大多数的菲律宾人并不理会极少数人的反抗新唐帝国掠夺菲律宾资源的挑拨，经历了近百年殖民统治的菲律宾对解救自己的新唐帝国感恩戴德。直到此时，原来对帝国首相制定的政策迷惑不解，甚至诋毁漫骂的一部分人才意识到了首相的杰出能力与智慧，转眼之间，郑庭节被公认为是新唐帝国有史以来最伟大的首相之一。英国人和日本人花了上百年时间都没有解决的菲律宾民族反抗运动，新唐帝国仅仅几个月的时间就解决了，这一事例在西方世界引起了极大的轰动，可西方的政客将军们却对此不屑一顾——欧洲人自认为是世界上最优秀的人类族群，理所当然的应该统治世界。至于殖民地，不进行掠夺压榨屠杀，那还叫殖民地吗？骄傲的欧洲人怎么能给予劣等民族与自己相同或相似的待遇呢？不行！绝对不行！那些土著人是劣等民族！不配！

而在菲律宾，铜矿，金矿，银矿，锌矿（银矿锌矿通常与金矿铜矿伴生），铁矾土矿（又称镍矿，主要金属为镍，次要金属为钴），铬铁矿，铝土矿，镁矿，以及硅矿，磷矿等大量的各种非金属矿藏源源不断的被从地下开采出来，提炼加工后川流不息的运往新唐帝国（南海已经几乎成为新唐帝国的内海），新唐帝国在这些不计其数的廉价资源的不停输入下，本已为战争所影响的国内经济又开始稳步上升，经济状况的好转又让战争时期的新唐军队得到了有力的支持与补充。。。