后燕虽然起步很快，慕容垂振臂一呼，就有大批将士归于麾下、大片领土收入囊中，但到了后来扩张的阶段，战争频繁，兵役劳役沉重，百姓缺衣少食，民间一片哀苦，反对的声音也越来越响，于是平定各处叛乱，成了后燕的日常。

385年中，慕容垂让鲁王慕容和担任南翼禁卫指挥官，镇守邺城，然后让骠骑大将军慕容农，穿过居庸关北上，一路经过凡城，直指龙城，集结各路兵马，讨伐叛将建节将军余岩。

一波未平，一波又起，余岩之乱尚未平息，南部的绎幕县人蔡匡，占领县城也宣告叛变，抚军大将军慕容麟和冠军大将军慕容隆，联合出兵镇压。

绎幕县紧临东晋疆域，东晋泰山郡长任泰，暗中出动军队，援救蔡匡。

城池久攻不下，而外援双到，无燕将领纷纷担忧，认为蔡匡之乱不可能立刻平定了，慕容隆却发现了好机会，召开紧急会议，传达了这一思想：“蔡匡仗恃他有外援，所以坚守不屈，一时难以攻下，现在计算任泰的部队，不过数千人，趁他们内外还没有会师，我们应该急行攻击，只要打败任泰，蔡匡失去幻想，自然就会投降。”

将士们悄然大悟，于是解除对蔡匡的包围，转而向任泰发起猛攻，最终大破晋军，杀敌一千多人，蔡匡果然献城投降。

慕容垂早已被叛将惹毛了，毫不含糊地斩了蔡匡，并把蔡匡的所有部众屠杀干净。

与此同时，骠骑大将军慕容农，已率军抵达龙城，先安排人马休息十多天，然后再向叛军发动攻击。

将领们都不理解，派代表提出质疑：“殿下北上时，行军迅速，可是到眼看离贼人却来越近，却又停顿不进，原因何在？”

慕容农胸有成竹地说：“我之所以很快地赶路，只是担心余岩翻过大山，大肆抢掠，伤害了善良的居民，现在停顿不前，那是因为我知道余岩的才能十分平庸，只不过是诱骗一些饥饿的民众，像乌鸦一样聚集在一起，并没有严格的纪律，只要扼住了他的咽喉，拖的日子一久，他的军队就会自己离散，不可能有所作为。”

将士们无不点头称赞，慕容农接着解释：“正值丰收时节，这里的农作物都已成熟，没有收割就离开，白白损耗自己的军粮，我准备把这里的庄稼收割完毕，再前往厮杀，前后也不过多等十天而已。”

没过不久，慕容农便率步骑兵三万人，南下进攻令支，余岩部众大为惊骇，许多人偷偷翻出城墙投奔慕容农，余岩最后也不得不束手就擒，被慕容农斩杀。

平定了余岩，慕容农乘胜进攻高句丽王国，收复了辽东、玄菟等地，志得意满之后，重回龙城，上疏请求整修祖先的坟墓祭庙。

慕容垂得知前线大胜，高兴之余，加授慕容农使持节、幽平以及北狄军区司令长官、幽州州长，镇守龙城，另让让平州督导官、带方王慕容佐，镇守平郭。

慕容农制订的法条政令宽厚简约，司法清廉公正，减少田赋捐税，鼓励耕种，督促养蚕，百姓生活日渐富足，数万名逃亡四方的难民也都前来投奔，为后燕北部边疆的稳定做出了突出贡献。

之前乐浪王慕容温在中山屯积了大量粮秣，还修建了豪华的宫殿，如今解决了后顾之忧，慕容垂便于本年12月23日，下令把中山作为国都，以避开西面和南面敌人的威胁。

次年春天，后燕朝廷迁都完成，慕容垂一改燕王称号，正式登极称帝。

迁都自然是为了国家的长远发展做准备，但随着后燕主力北移，南部露出破绽，让一些别有用心的人，有了可乘之机。

丁零部落酋长翟真，被叛将鲜于乞谋杀时，堂兄翟辽趁乱逃走，投奔了东晋黎阳郡长滕恬之，滕恬之正与后燕对峙，认为这是知己知彼的好机会，对翟辽十分信任，结果翟辽却暗中用小恩小惠笼络人心，趁着滕恬之出城与后燕作战的机会，紧闭城门，占领了黎阳，并将滕恬之擒杀。

东晋豫州督导官朱序得知此事，大为愤慨，立即派将军秦膺、童斌，会同淮河、泗水各郡的士卒，共同讨伐翟辽。

但翟辽毫无道德压力，打仗奋不顾身，纠结一帮亡命之徒，屡次击退东晋的进攻，并在后燕的南部边境大肆掳掠。

久战无功之下，东晋泰山郡长张愿抵不住压力，献城叛变，投奔翟辽而去，附近许多小城和堡寨也都前往归附，于是遭剿灭的翟氏丁零势力，死灰复燃。

不过此时的翟辽，相比后燕来说，仍旧处于萌芽状态，刚称皇帝的慕容垂，新鲜劲十足，并没有把翟辽放在心上，而在祭庙中忙碌起来。

慕容垂准备追尊母亲兰氏为文昭皇后，然后把嫡母文明皇后段氏的牌位，迁出皇家祭庙，而由母亲兰氏的牌位，配坐父亲慕容皝之旁，为了确保能得到百官的支持，特意有模有样地下诏询问大家的意见。

官员们多数不是汉人，对于儒家的规矩并不在行，几乎全都表示支持，儒家教授刘详和董谧，则提出异议，认为此举不合礼法。

慕容垂大怒，本来下诏并非真的是询求意见，只是为了得到支持而已，哪里想到刘董二人这么认真，于是暗中对他们施加压力，希望能让他们同意，但二人却十分执着，回说：“陛下一定要这么做，就不必询问我们的意见，我们臣属的意见一切都遵守经典礼仪，绝不敢违背。”

慕容垂顿感无语，可也不好下令惩处，但从此不再理会儒家学者，而且仍然把嫡母段皇后逐出祭庙，而以兰皇后的牌位代替，又因皇嫂可足浑氏让国家倾覆，下诏把她废为平民，追尊慕容俊的昭仪段氏为景德太后，与哥哥慕容俊共享香火。

处理完了这件关乎面子的大事，慕容垂终于可以把精力放在稳固统治上了，任命范阳王慕容德为政府最高长政长官、太原王慕容楷为政府左副行政长官、乐浪王慕容温为京畿卫戍总司令，接着派太原王慕容楷、赵王慕容麟、陈留王慕容绍和章武王慕容宙，分别攻击前秦冀州州长苻定、冀州军区司令长官苻绍、幽州州长苻谟和幽平军区司令长官苻亮。

前秦的这几位，原来已投靠后燕，但听说苻丕在晋阳称帝后，便回归前秦怀抱。

有此背景，慕容楷也不急动用武力，而是先写信分析祸福利害，几人本就难在前秦立足了，一经商量，果然全都归降。

燕军将士都劝慕容垂杀了这几人，以免他们再度反水，但慕容垂回拒了，反而一律封他们为侯爵，为避免部属误会，特意解释道：“秦国已到了穷途末路，对我们构不成威胁，权且以此来回报天王当初的恩德吧。”

清理了前秦的隐患，慕容垂再让太子慕容宝留守京师中山，让赵王慕容麟担任政府右副行政长官，主管留守朝廷，然后亲率慕容德等人，南下夺取土地，另派慕容隆向东直指平原郡，掀起了新一轮的扩张狂潮。