小智终于在船内的厨房追上了火箭队，火箭队也没打算逃，本来他们的目的就是趁乱抢夺化石，然后借助大海远遁。现在计划没变，只是时间推前了而已。
“小鬼头，乖乖将化石交出来！否则…哼哼…”武藏撂下狠话来。
“我看是你们乖乖留下徽章，以免又被打飞出去。”小智就算想给化石，也没有啊，化石早被小蓝偷换去了。
“是吗？即使徽章被毁也无所谓是吗？那么我可扔咯…”武藏得意的挥挥手里的橘色徽章说道。
“卑鄙！”
“哼！废话少说了，你到底交还是不交！”武藏可没耐心拖下去了，她迫切的想获得老大的赞赏，从而升级当干部。
小智咬咬牙，他就算想给也没有办法啊，化石早就被小蓝掉包了。正无可奈何之际，船身发生了剧烈的震动，伴随而来的还有轰隆声和警笛声。剧烈的震动让所有人都站不稳，小智紧抱着伊布大声问道：“发生什么事了啊？”
警报器传来船长的声音“本船已经沉没，不过请大家不要惊慌，请速去甲板，按序逃生。再播报一遍本船已经沉没，不过请大家不要惊慌，请速去甲板，按序逃生！”
“什么？船沉了？”小智等人惊讶的叫喊着。
“不管怎么样，先抢到化石再说！”武藏坚决的说道，立马获得小次郎和喵喵同意：“上吧，阿柏蛇！”
“你也去，瓦斯弹，今天不管是船沉还是船不沉，我们都要抢到化石！”小次郎拿出瓦斯弹说道。
“真是纠缠不清，小霞，你先去甲板逃出去吧，等我抢回徽章立刻赶过去……”小智话还没说完，却被小霞愤怒的打断。
“小智你说什么！我才不会先逃走呢，要走一起走！”“皮卡皮卡！”小霞和皮卡丘都很坚决的说。
小智很感动，点点头，拿出宝贝球：“巴大蝴，就决定是你了。”
“去帮忙吧，我的海星星，用水枪攻击！”小霞不含糊，立马指挥海星星进攻过去。
“瓦斯弹，泥攻击！”“阿柏蛇用溶解液！”
瓦斯弹喷出毒泥，将海星星击退到一边，阿柏蛇的溶解液却被巴大蝴轻盈的躲闪过去。
小智不会被打而不还手的，立刻让巴大蝴使出烈暴风，趁着巴大蝴的攻击，海星星摆脱淤泥一个高速旋转将瓦斯弹撞出去，瓦斯弹又将阿柏蛇撞到，火箭队的神奇宝贝乱成一团糟。
“趁现在，巴大蝴！使出念力吧！”小智道。
被念力控制的瓦斯弹撞破门，晕了过去，但阿柏蛇晃晃悠悠的，却又站了起来。
“我还有杀招呢…去吧，大针蜂！”小次郎拿出常磐森林收服的大针蜂来。
在小智和火箭队战斗的时间里，圣安奴号船尾漏水，船尾已经开始下沉，船上的人们都在君莎小姐的安排下，有秩序的逃到救生艇，现在船上只剩下小智和火箭队等人了。
船身又发生了倾斜，小智知道战斗如果再拖下去，他和小霞可能就会逃不出去而葬身大海的。小智对巴大蝴喊道：“巴大蝴，快解决掉他们！”巴大蝴点点头，挥动着翅膀，扇出的却不是烈暴风，而是银色闪着光芒的银色旋风！
“学会这招了吗？好，巴大蝴用银色旋风！”小智大喊着。
银色旋风将大针蜂及火箭队等人吹飞出去，橘色徽章从武藏手中掉落下来，被皮卡丘迅速的拾了起来。
小智接过皮卡丘手中的橘色徽章，终于心中的一块大石落地了：“谢谢，皮卡丘！”又对小霞说道：“小霞，这艘船快要沉了…我们快点逃吧！”
“恩，走这边。”小霞指了指被火箭队撞开的门。
小智收回巴大蝴和伊布，同皮卡丘一起冲出门外。
船尾发生连续的爆炸，船沉的越来越快了，转眼就大半没入水里，船内也开始进水。感觉到船倾斜越来越狠，小智知道这是船尾已经沉了，他现在只希望可以尽快赶到甲板上。可是他不知道，本来招待的人就没有小智和小霞的名字，警方以为所有人员都已脱困，所以已经带着获救的人回港口了…
小智和小霞拼命的赶着，而船也拼命的沉没着。这是一场与时间的赛跑，一场拿性命作赌注的比赛！
小智和小霞赶到甲板上，两人惊呆了，四周除了蔚蓝的海水，根本看不见任何活物。
“怎么办啊小智？”小霞紧张的问“再这样下去，我们都会跟着船沉入海底的！”
小智握紧着拳头，他知道小霞说的很对，只是现在他也没有办法啊。小智愧疚的看着小霞，刚想说什么，身后却又传来那些烦人的声音。
“小鬼头，不将化石交出来，我们做鬼也会缠着你的！”火箭队又跟着来到了甲板，看他们的样子，似乎又想打一场。
“火箭队！你们也太纠缠了吧！这都什么时候了？还想打？不要命了吗？”小智大声骂道。
火箭队的两人看看四周，惊吓的抱在一起喊着：“妈呀，怎么会这样？”
整个船已经成45度了，只有甲板一头还露在海面上，其他的都淹没在海水里了。“所以，如果你们要在这里战斗，我们几人肯定都葬身海底。”小智说道，他并不怕火箭队，只怕战斗会让船沉的更快。
“不管船是沉也罢，还是不沉也罢，我们誓死要得到化石！”火箭队三人语气肯定的说。
小智叹了口气，无耐道：“化石已经不在我身上了，早就被别人调包换走了。”
火箭队三人相互看了一眼，说道：“真的？既然这样，那我们先休战吧！你有什么办法能让我们逃出去吗？”
小智摇摇头：“没有…”
“哇啊…”所有人惊叫着，从船的一边滑向舱门那边。
“不好，船沉的速度变快了。”小智大喊着。“哇噻，看啊，好多的玛瑙水母和毒刺水母哦，好可爱啊。”小霞指着海面说道。小智立马赶过去，果然，许多的玛瑙水母和毒刺水母依附在船底。是它们的原因才使船沉的更快的…
“小霞，现在不是兴奋的时候，快将这些水母赶走，不然我们都会沉下去的！”小智急忙说道。
“哎？有这样的事？”小霞对水系神奇宝贝喜爱让她不相信这么可爱的孩子们会做出这样的事。
小智可管不了那么多，拜托了皮卡丘去驱逐那些玛瑙水母，武藏小次郎也分别拿出化石盔和菊石兽前来帮忙…小霞逼不得以，为了不那么快送命，只好对它们说对不起咯！
小智等人的驱赶让玛瑙水母和毒刺水母愤怒起来，开始了反击，毒针、泡沫光线从海面那打上来，绝招打在船上发生了爆炸，小智急了，如果这么下去，自己还没想到办法船就得沉了，那么大家都有危险了。
小智朝水母群望去，一般大群行动的神奇宝贝肯定都有一只领头的，只要击败那个领头，驱赶它们就不困难了。小智在水母群中找到一只体型硕大的毒刺水母，它没有进攻船，而是远远的看着…难道是它？小智心想道，然后指着那只毒刺水母对皮卡丘说道：“皮卡丘，对着那只毒刺水母使用十万伏特。”
皮卡丘放出电，打中在那只毒刺水母的身上，毒刺水母吃痛，沉下了海底。如小智所料，这只大型的毒刺水母就是这群水母的领头，它一倒下去，玛瑙水母们都退散而去，潜入海底。众人松了口气，却不知道更大的危机已经到来。由于刚才的攻击，船四处进水，以更快的速度下沉。
“来不及了，先离开这艘船吧！”小智对小霞说道，又对火箭队说：“你们也最好离开这艘船，否则…”
火箭队三人相互望了望，点点头，决定跳海后再寻生路。
小智愧疚的看着小霞：“连累你了，小霞。如果不是因为我，你应该早就可以随大家逃出去了吧…”
小霞用手轻轻遮住了小智还要喋喋不休的嘴，她摇摇头说：“是我自愿留下来陪你的，不要再说什么抱歉的话了，我们也快点离开这吧。”
小智望着真诚的小霞，忽然感觉眼角有点什么露出，他赶紧擦去，点点头对小霞道：“那我们走吧。”
来到甲板最顶端，船身已经成90度直线了。小智站在船沿，看了看大海，问：“小霞，你怕吗？”
小霞摇摇头，盯着小智的眼睛：“有你在，我不怕。”说完红着脸低下了头。
小智愣了一下，伸出手，拉住小霞的手，两人之间不用再多说些什么了…
“你跳，我也跳。”小霞紧握着小智的手突然说道。小智惊讶的问：“你也看过泰坦尼克号？”
“啊？什么…”望着小霞满头问号，小智明白原来她只是随口说说而已，也是，那个世界的电影在这个世界怎么可能会发生呢？小智自嘲的笑了笑，看了小霞一眼，两人同时点点头，从船沿纵身跳下去，皮卡丘也紧抓着小智的肩膀。
“啊……”小智和小霞尖叫着，眼看快要落进海中，小智转头对小霞突然说道：“小霞，我想我可能喜欢上你了…”“啊？你说什么？”小霞大声问，因为风的呼呼声，加上小智声音也不是很大。
小智于是鼓足了气大声喊：“我喜欢你！小霞…”
“…”小霞脸红了起来，怎么会在这个时候…那个苯蛋！“还是听不清楚，等会再说吧。”小霞装模作样的说着。
小智也乖乖的不再说了，第一次告白就这样失败了。倒是皮卡丘很无奈的叹口气，这都什么时候了，还有心思告白？不电一电他，怕他还搞不清状况啊。
眼看小智和小霞快要落入海中，突然小智腰上的神奇宝贝球打开来，一只神奇宝贝擅自出来了，是暴鲤龙！暴鲤龙比小智先一步落入海中，然后稳稳的将小智和小霞接住。
“多亏你了，暴鲤龙。”小智在确认小霞没受伤后，对暴鲤龙说道。
皮卡丘也拍拍暴鲤龙的龙头，给它赞赏几句，同时佩服它的勇气！擅自逃出宝贝球，训练家是可以就这样丢弃它的。
暴鲤龙尴尬的落出笑容，情况危机，迫不得以！何况它知道小智不可能责怪它的，又怎么会丢弃它呢！
既然有了暴鲤龙的帮忙，那么逃出海就简单多了。小智派出超音蝠去空中寻路，在超音蝠和暴鲤龙的配合下，小智一行人顺利的离开茫茫大海，来到蓝普尔其度假海滩，可怜火箭队三人，搭在木筏上，迷路在茫茫大海之中…“菊石兽，右边！”“化石盔，去左边…”“右边！”“左边！”……
绝路逢生，本来应该好好高兴一下的，可是小智却没那闲功夫，他不断的打电话去打听小蓝的消息，究竟她拿化石去干什么呢？小智百思不得其解。毫无头蓄的小智来到海滩边，正看见穿着泳衣的小霞带着皮卡丘它们在戏水。小霞和皮卡丘也发现了小智，看他没精神的样子，便想拉他好好玩上一番，换换心情。
“喂，小智，下去一起玩吧？”小霞来到小智面前说道。皮卡丘和伊布纷纷跳进小智怀里，小智抱着这两个家伙，看着伊布身上的铃铛，又让他想起小蓝来…小智本来微笑的表情突然变的严肃起来，让小霞和神奇宝贝们担忧起来，小智感到异常，抬头一看才发现，大家都因为自己的事而担心了。
“大家…”小智忽然明白，如果自己不开心，会影响到所有人担忧的，这不是他想看到的。
“好吧，大家一起去海边开心的玩吧！”小智脱掉上衣冲大伙喊着。见到小智笑容又回来，所有人都放心下来，追随着小智冲进海水里。
小智下水后才发现，原来大伙都在呢，皮卡丘、伊布、大钳蟹、暴鲤龙、巴大蝴、超音蝠，还有小霞的神奇宝贝们，海星星、角金鱼、墨海马！
大伙又开始了水仗，小智带着伊布、大钳蟹、海星星、超音蝠为一组，对抗小霞和皮卡丘，角金鱼，巴大蝴，墨海马这组。暴鲤龙嘛…它？它不知道和谁家的母暴鲤龙勾搭在一起，自然固不上玩刷咯。小智将附近的店里借来的排球抛向天空，大喊着：“要来咯！”用力的将球拍打过去！游戏规则很简单，球在谁场地落下，就是输家！输的一方要给对方洗一个月的衣服。哈哈
球飞转到小霞那边，皮卡丘一跃而起用尾巴把球又击打回去。“干的好，皮卡丘！”小霞开心的赞扬着皮卡丘，皮卡丘漂亮的竖起V字手。“还没结束呢，接招！”小智故意将球向小霞那里打去，小霞可不会被吓到，正要去接球，却听到小智大喊一声：“有虫啊…”
“什么，有虫？”慌乱的小霞让球跌落到地上了。
小智那组哈哈大笑，先得一分了。小霞忽然明白自己被小智耍了，她气愤得说道：“小智！你耍诈！”
小智得意的摆摆手，说道：“兵不厌诈，这个道理你不明白吗？这可不能怪我。”
“你…你…好，看我怎么收拾你！”小霞拣起球，发起了第二轮比赛。
球被小霞抛起来，皮卡丘阴险的在球上发出一丝电击，小智一接触到球，立刻被电麻过去，球落地，小霞队扳回一分。
恢复过来的小智，盯着皮卡丘，好家伙，敢这么阴我，真不厚道。小智把球交给超音蝠，竟然用绝招了，我们这边也不能认输。超音蝠首先用超音波干扰众人，然后用翅膀将球拍打过去。皮卡丘和小霞被超音波弄的混乱过去，几只水系的却潜入水中躲避过超音波，角金鱼用角撞将球撞过去，墨海马则趁机将小霞、皮卡丘、巴大蝴叫醒。球飞向小智阵营的一处空当，小智阵营可不据有速度型的搭档，想追上去不容易啊。
眼见球要落地，突然杀出来的海星星用高速旋转将球击打向空中，小智大声赞扬着海星星，让空中的超音蝠再次发动进攻……比赛如火如荼，小智阵和小霞阵互不服输，你来我往，渐渐的天都黑了。
“吼吼…”处对象回来的暴鲤龙，表示要加入小智阵营。“好，太好了，有你的加入这场比赛赢定了！”小智开心的说道。
暴鲤龙听到小智的话，十分高兴，正好此时球飞了过来，暴鲤龙二话不说，一破坏死光喷出去，破坏死光接触到排球，立刻把球打的粉身碎骨，众人都傻了眼…过了好半天，小霞那边暴发出激烈的欢呼声，由于刚才暴鲤龙将球击碎，一直平手的局面打破了，胜了这场比赛的是小霞队。
“怎么这样…”小智丧气的说道，暴鲤龙尴尬的缩了缩大头，虽然它还搞不太清状况，但很明显，它又干错什么事了。
“怎么样小智？一个月的大小事情都交给你咯，现在还不快为我们准备晚餐～”小霞得意的拍拍小智肩膀说道。“是！大小姐。”小智很快从丧气中恢复过来，本来他就负责了这一路上所有的大小事务了，况且比赛就是为了让众人开心，既然目的都已经达到了，那还有什么可丧气的呢！
晚上，小智准备了一桌丰盛的晚餐招待大家，神奇宝贝们的食物也是特制的，这可是小智花了不少心思的呢。蓝普尔其的一日度假在欢声笑语中结束了，但小智的旅行却刚刚开始呢……
看着海滩聚餐的小智等人，蓝发女孩匆匆的离开了，“这家伙，哼！”