除了这4支舰队，联邦海军还有3个重要部门，后勤部、训练部和情报部，前两个部门分别掌管着联邦海军的装备、补给、医疗、船只修理、改装和后备海军军官、水兵、飞行员、地勤等人员的招收和培训工作，总部位于安中省岘港。 而情报部则和联邦空军的情报部一起掌管着联邦境内的所有海岸雷达站，负责监控联邦海岸线和近海的船只和飞行物。
另外，刘芾还为联邦海军增加了一个新兵种，那就是海军陆战队。其实这个兵种还欧美各国早就存在了，主要是为了配合海军舰艇，做一些突袭或者登陆占领的任务，以前，在南海联邦中，这些任务都是由陆军担任的，现在，刘芾决定也给联邦海军配上这个兵种，人数到不用太多，1个师，27000人左右，番号为联邦海军陆战一师。
到1923年，联邦海军的作战舰艇总吨位将达到65万吨，除了英国和美国之外，联邦海军的舰船吨位数将排在第三位。
除了一支大海军，南海联邦还正在拥有一支大空军，自从1906年联邦空军成立至今，作战飞机已经更换了2代，人数也由当初的2000多人增加到了50000人，下辖4个空军基地、11个正式军用机场，3家飞机制造公司，同样，国防部为了方便调配和明确任务，把联邦空军也划分成了3个主要司令部，分驻在不同的区域。
北方空军司令部。驻地为安中省顺化空军基地，下辖3个飞行联队，飞机总数80架左右，其中作战飞机60架，多数为隼式战斗机、侦察机和鹰式对地攻击机，其余为鹅式运输机。北方空军司令部的控制范围为泰国、缅甸边境地区以及北部湾、泰国湾等海域，主要防御方向是联邦与泰国、缅甸的陆地边境，作战对象是英国和印度军队，主要任务是利用安北、安中和安南三省内的多处军用机场，对控制范围内的目标进行日常巡逻、敌情监控、作战训练。
西方空军司令部。驻地为苏门答腊岛上的巨港空军基地。下辖4个飞行联队，飞机总数量120架左右，其中作战飞机100架，隼式战斗机、侦察机。贼鸥舰载鱼雷攻击机空军型号。鹰式对地攻击机都有一部分。剩余数量为运输机。西方空军司令部的控制范围包括马来半岛、苏门答腊岛、爪哇岛、马六甲海峡、巽他海峡，主要防御方向是西部和西南部，做咱对象是英国和印度海军从海面发起的进攻。主要任务就是利用马来半岛、苏门答腊岛和爪哇岛上的军用机场，在战时帮助联邦海军打击敌方舰船或者封锁马六甲海峡以及巽他海峡。
南方空军司令部，驻地为新几内亚岛上的莫尔斯比空军基地，下辖4个飞行联队，飞机总数量120架左右。南方空军司令部的控制范围包括小巽他群岛以及周边海域、新几内亚岛及其周边海域、苏拉威西岛、澳大利亚北部沿海等地，主要的作战对象就是澳大利亚和新西兰两国，如果他们有空军的话。
东方空军司令部，驻地为吕宋省的马尼拉空军基地，下辖3个飞行联队，飞机数量80架左右。东方空军司令部的控制范围就是菲律宾群岛以及加里曼丹岛以及周边海域，主要的作战对象就是日本和美国，不过联邦同这两个国家相距甚远，在短期内，双方都无法利用飞机威胁到对方本土。
除了这4个空军司令部之外，刘芾还为空军增加了一个兵种，那就是伞兵部队，也叫空降兵部队。由于联邦的鹅式运输机飞行距离和载重量都已经达到了一定标准，在这个基础上，刘芾认为可以发展一支空降兵部队了，虽然现在没啥用，但是说不定将来就是一支奇兵呢。既然是半试验性质的，那么这支空降兵部队的人数也多不了，只有一个旅7000多人，被刘芾命名为第一空降旅。
最后一个，就是联邦陆军了，由于联邦的领土大多是岛屿，所以联邦陆军的数量而后重视程度，一直都是排在海军后面，现在，有迹象表明，很可能又要被空军挤下去了，没辙啊，环境决定的，这么多海岛，没有强大的海军和空军，光靠陆军守，得多少陆军才够啊，而且一开战，如果海陆被敌人切断了，那岛上的陆军不就成孤军了。
在国防部的规划中，联邦陆军将从以前的4个师扩编到6个师，总计16万人左右，由于联邦的领土多是热带岛屿，雨林众多，所以在这次扩编的2个师中，专门给了一个山地师的编制，不过说是山地师，其实叫热带师更合适，他们主要是从加里曼丹岛、苏门答腊岛、菲律宾等地招来的当地人，然后配备上华人指挥官，充分利用他们在热带雨林中的生存能力，再加上严格的训练，使之成为一支能够适应热带雨林地区作战的部队。
联邦陆军的步兵在装备上主要以半自动步枪、机枪、重机枪为主，配合迫击炮、火焰喷射器、地雷、手榴弹进行作战。在交通状况许可的情况下，联邦陆军还会装备大量装甲车、摩托车、轻型坦克和卡车，不过由于联邦陆军主要是一支防御型的部队，而联邦境内的地形太过复杂，所以联邦陆军没有装备大口径重炮。
这6个步兵师的兵力，将主要分布在联邦的北部，尤其以马来半岛和安北省为主，在这两个省与泰国和缅甸的边境附近，都驻扎着一个联邦的陆军师，而在安中省和安南省，也驻扎了一个陆军师。
其余的3个师，一个驻扎在菲律宾群岛和台湾岛上，一个驻扎在加里曼丹岛上，剩下的一个分驻在苏门答腊岛、大小巽他群岛以及新几内亚岛上。
这些陆军就是联邦的最后一道防线，如果敌人已经需要联邦陆军去对付了，那么联邦的防线也就基本被突破了，当然，联邦与泰国和缅甸陆地接壤的边境不算。
另外，联邦国防部为了方便后勤和作战指挥的方便，把联邦海军、空军、陆军的所有装备都分别编制了代号。其中海军装备以英文海的s为代号，空军以英文空气的a为代号，陆军以英文陆地的l为代号。
在这些代号下面，又划分了个军种中不同种类装备的编号，海军的飞机母舰编号为aircraft carrier的缩写a，巡洋舰的编号为c，驱逐舰的编号为d，护卫舰的编号为f，巡逻艇的编号为p，鱼雷艇的编号为t，潜艇的编号为s；由于联邦海军并不打算建造和装备战列舰，所以代表战列舰的b编号并没有实际使用，不过为了应付有可能发生的情况，比如俘获敌方战列舰等等，所以这个b编号还是保留了下来。
空军的飞机编号类同海军，攻击机的编号为a，轰炸机的编号为b，运输机的编号为c，侦察机的编号为d，教练机的编号为e，战斗机的编号为f，试验机的编号为x，原型机的编号为y；海军航空兵的飞机编号也按照空军飞机编号，只不过在打头字母上，是代表海军的s字母，不是代表空军的a字母。
陆军的装备编号与海空军有些区别，由于陆军的装备太多，太复杂，只能先归类，再分级。陆军的作战车辆包括各类坦克、装甲车的编号为a，运输车辆包括摩托车、卡车等的编号为b，火炮包括加榴炮、迫击炮、高射炮等编号为c，机枪类武器包括重机枪、轻机枪、班用机枪等编号为d，单兵枪械包括自动步枪、冲锋枪、半自动步枪、步枪以及他们的改装型等编号为e，所有的手枪编号为f，手榴弹、地雷等编号为g，所有刀具编号为h等。(未完待续。。)