孙权上位之后，有很多人兵不服他，也有人对他没有信心，但孙权通过自己的实际行动，最终成功站稳了脚跟。
【李术之乱】
孙权在继位之初，他的权威并没有立起来，江东集团本来控制了扬州的豫章、吴郡、会稽、庐陵、庐江和丹阳等六个郡，其中的庐江太守李术对于孙权就很不服气，可能觉得他年龄小，也没有什么功绩，遂有心自立，准备脱离孙权的控制。
李术一方面不肯服从孙权，还收容孙权部下的叛徒。孙权写信要求他把这些叛徒交给自己，结果李术回信拒绝，直接表示你孙权如果有德我自然会归顺于你，你如果没有的话我当然会叛变，多余的就不要说了。孙权看完之后极为愤怒，下定决心消灭李术。
但庐江郡和曹操的领土直接相连，所以孙权想要讨伐李术得顾及曹操的反应，当时曹操挟天子而令诸侯，势力强大，所以孙权提前与曹操进行了沟通。
据《江表传》记载，当时孙权把这些情况报告曹操，说道：“扬州刺史严象，是您从前任用的，却被李术杀害。李术肆无忌惮地杀害朝廷官员，应当尽早诛灭。如今我出兵征讨，李术必定还会花言巧语，向朝廷求救。您身负天下重任，一举一动，都会被全国所注意。请求您告诉负责具体事务的官员，不要再听信李术的话。”
于是孙权进军皖城，围攻李术。李术闭门自守，向曹操求救，曹操不加理睬。后来城内粮食耗尽，有些妇女甚至吞泥土和石子充饥。皖城被攻下后，孙权放纵士兵屠城，砍下李术的人头示众，把李术的部属三万余人都迁到自己的控制区内。
李术之乱就此被孙权平定，庐江也重新被其控制在了手里，之后孙权以孙河为庐江太守。
【孙辅之患】
当时除了远在庐江的李术外，就连孙家内部也有不少人认为孙权不可靠，当时的庐陵太守孙辅作为孙权的从兄弟，就担心孙权无法保住江东，当时他已经迁平南将军，假节领交州刺史。却在暗中同曹操交通，后被孙权发现，直接被幽禁。
据《典略》记载，当时孙辅担心孙权没有能力保守江东，趁孙权出行时派遣使者与曹操暗中来往。结果孙辅暗通曹操之事，被人告发，孙权回来后，假装不知道此事，与张昭共同召见孙辅，对孙辅说：“兄弟之间不愉快说出来，为什么要叫外人来呢？”孙辅否认没有此事，孙权将孙辅与曹操往来的书信拿给张昭，让张昭拿给孙辅看，孙辅惭愧的无言以对。孙权于是尽杀孙辅的近臣，削减他的部曲，将他流放到东部幽禁。
【丹阳之乱】
建安八年（203），丹阳太守吴景因已故骤逝，孙权的三弟孙翊遂以偏将军领丹杨太守，时年二十岁。
当初孙权杀吴郡太守盛宪，盛宪以前的同僚孝廉妫览、戴员逃亡匿藏于山中。孙翊到了丹杨上任后，以礼罗致妫览为大都督督兵，戴员为郡丞，结果孙翊却被他们所害，当时的庐江太守孙河飞马疾赴宛陵，怒责妫览、戴员，说他们未能尽心职守，致使奸邪事变发生。二人私下商议说：“孙河与孙翊将军疏远，还这样指责我们。若是讨虏将军孙权前来，我们就无法活下去了。”于是杀死孙河，派人北往迎请扬州刺史刘馥，让他出兵镇守历阳，他们就率丹杨之众来响应。而后孙翊的部下徐元、孙高、傅婴等又杀死妫览、戴员，结束了这场叛乱。
据《吴历》记载，妫览、戴员亲近边鸿，数次被孙翊责难，于是密谋叛变。因孙权出征江夏太守黄祖，他们就找到机会实行奸计。其后丹杨郡诸县令长一齐会见孙翊，孙翊命妻子徐氏为他作宴卜卦，徐氏说卦相不佳有凶卦，劝孙翊不要作宴了。而孙翊认为长吏来了很久，应该尽快让他们离开，于是开始送客。平时孙翊出入时都会持刀，当时因有醉意，所以空手送客，边鸿于是从后斩杀孙翊，当时郡中所有人都很忙碌，无人去救孙翊。边鸿杀害孙翊后逃入山中，终被追捕的徐氏擒获。妫览和戴员将杀孙翊的罪责都推给边鸿，并且杀掉他，但丹阳的军士与孙权的军士都认定罪魁祸首是妫览和戴员，但却无力讨伐他们。
妫览之后更是肆无忌惮，他进入了孙翊的府中，夺取了原来孙翊的嫔妾及左右侍御，还准备要孙翊的妻子徐氏，徐氏却说：“请您等到我祭奠先夫之后”。
她找到了孙翊生前的亲信虎将孙高、傅婴二人，向他们哭诉了孙翊死亡的真相。孙高和傅婴听后，非常感动且愤怒，回复徐氏：“我受到府君（孙翊）的恩遇，之所以不当即就去死，是认为死是没益处的，想要有事情计划，但没有想好，不敢告诉夫人罢了。今日之事，实在是日夜所想的啊。”答应和徐氏合作共杀叛贼为孙翊报仇。于是，徐氏策划安排将他们藏在自己的卧室里，然后妫览月底当天迫不及待急着把徐氏娶为妻，徐氏用美貌引诱他进卧室。这个时候，徐氏大喝：“二位将军还不出来杀贼，更待何时！”预先埋伏的孙高和傅婴冲出来，将妫览砍杀身亡。接着，徐氏用同样的方法，把戴员也诛杀了，并将他们的首级祭孙翊墓。
孙权过来之后，将妫览、戴员的余党悉数诛灭，提拨孙高、傅婴为牙门，其他有功人员，也都受到不同的党赐。
历史上孙翊会有这个下场，可以说是自找的，在孙策把兵权交给孙权之后，可能孙翊并不服气，于是他拉拢因为盛宪之死而与孙权不和的妫览、戴员，并且委以重任，其心思昭然若揭。他可能认为妫览、戴员和自己志同道合，可以帮助自己对付孙权，但人家不是这么看，在别人看来孙翊就是孙权的弟弟啊。
事后诸葛亮来说，当时孙策选定孙权为继承人而不是孙翊，真心是英明无比。